的分离技术依靠化合物的分子运动平均自由程的差异进行分离，这可以进一步增加化合物之间平均自由程的差异，因而该蒸馏过程可以在低温度下进行蒸馏。待分离化合物会在成膜部件的作用下形成2mm左右厚度的液膜，液膜状的蒸馏利于待分离化合物的逸出。同时分子蒸馏分离过程中，冷凝面与蒸发表面的近距离布置，使得待分离化合物一旦逸出就能很快冷凝，因而减少了热敏性待分离化合物在高温下的停留时间，利于保持化合物的特性。
当液体混合物沿加热板流动并被加热，轻、重分子会逸出液面而进入气相，由于轻、重分子的自由程不同，因此，不同物质的分子从液面逸出后移动距离不同，若能恰当地设置一块冷凝板，则轻分子遇到冷凝板被冷凝排出，而重分子达不到冷凝板沿混合液排出。这样实现物质分离的目的。 带有加热夹套的圆柱型筒体，转子和内置冷凝器；在转子的固定架上装有刮膜器和防飞溅装置。内置冷凝器位于蒸发器中，转子在圆柱型筒体和冷凝器之间旋转。从加热面上逸出的轻分子，经过短的路线和基本未经碰撞就到内置冷凝器上冷凝成液，并沿冷凝器管流下，通过位于蒸发器底部的出料管排出；残液即重分子在加热区下的圆形通道中收集，再通过侧面的出料管中流出。
夹套的长度与分段则根据提供能源的途径、冷凝器结构以及刮板具体尺寸等参数来明确。当能源为导热油时，夹套内可以考虑设置导流板，以强化加热器的蒸发传热过程。筒体与上下封头组成密闭空腔， 连接处要采用密封结构，以符合分子蒸馏过程的严格要求。在特定条件下还要考虑磁流体密封结构，如果系统有要求时，也可以考虑磁力驱动设计，转轴处的动密封就转变为静密封，符合真空度的要求。设置原料液除气器，以便除去被设备内吸附的空气或挥发性不凝成分，应根据系统具体要求，可设计为多种形式：壁面反射式、层板式、填料式、降膜式等；也有采用刮板薄膜蒸发器作为原料液除气器的。